Durante el periodo Sengoku, un medio demonio (hanyō) llamado InuYasha roba la Perla de Shikon con el objetivo de convertirse en un demonio completo (yōukai). Sin embargo, su plan es frustrado por una sacerdotisa llamada Kikyō quien, utilizando sus últimas fuerzas, le dispara una flecha, clavándolo en el árbol sagrado (Goshinboku); dejándolo paralizado y dormido por 50 años. Posteriormente la sacerdotisa, antes de morir, pidió que su cuerpo fuera quemado junto con la joya.
Luego de 500 años, en el Japón actual Aome Higurashi, una adolescente de 15 años, sale de su casa hacia la escuela y su gato desaparece junto al pozo que se ubica en el templo de su casa. Al buscarlo ahí, un demonio ciempiés sale del exterior del pozo y transporta a Kagome a la época feudal, 500 años atrás. Allí, al descubrirse que poseía poderes especiales, se le considera la sacerdotisa mas poderosa de esa epoca y se le entrega la perla de Shikon con el objetivo de custodiarla y seguir con la labor de la muerta sacerdotisa.
Lamentablemente, en un incidente provocado por un cuervo la joya fue destruida en miles de fragmentos, que cayeron en distintas partes de la región. Debido a esto, InuYasha, ahora despierto y liberado, junto a Kagome tienen la misión de recuperarlos antes que el ser llamado naraku se apodere de ellos, lo que provocaría varias catástrofes.
Durante su recorrido, ambos conocen a Shippo; un pequeño zorro yōkai huérfano de padre;Miroku un monje con una poderosa maldición que amenaza con matarlo del mismo modo que pasó con sus ancestros, Sango; una guerrera dedicada a exterminar a yōkais que causen problemas a la gente, cuyo hermano menor Kohaku fue asesinado, resucitado y ahora es manipulado, y finalmente su mascota, una nekomata llamada Kirara. Todos, por situaciones diversas y relacionadas con el pasado de cada uno, se unen en la búsqueda de los fragmentos para evitar que caigan en las manos de un Hanyō llamado Naraku, el enemigo principal de la serie el cual es el responsable de numerosas tragedias de cada uno de los personajes de la obra entre las que se cuentan el desamor de InuYasha y Kikyō que terminara con InuYasha sellado en el Árbol sagrado y la posterior muerte de la Sacerdotisa; la maldición ancestral de Miroku que amenaza con matarlo y finalmente, la muerte de todos los miembros del clan de Sango.
Además de tener constantes enfrentamientos con Naraku y sus extensiones, InuYasha y sus amigos tendrán que enfrentar otros problemas entre los cuales están el medio-hermano yōukai del protagonista, Sesshōmaru, quien lo detesta por sus orígenes híbridos, y a la propia Kikyō, quien es resucitada en un cuerpo hecho a partir de sus cenizas, barro y huesos humanos quien desea vengarse y también a Koga, un hombre lobo procedente de una tribu de lobos cuyos camaradas fueron asesinados por Naraku, que desea vengarse del Hanyō y se disputa con InuYasha el amor por Kagome.
Finalmente tras muchas dificultades, Naraku consigue recolectar todos los fragmentos de la perla de Shikon y consigue contaminarla por completo. Sin embargo, Kagome puede notar que Naraku tiene el temor de perder su humanidad y esto hace que el Hanyō titubee en su deseo. InuYasha y sus compañeros deciden enfrentarlo y a pesar de finalmente derrotar a este ser, Naraku consigue lograr su objetivo: hacer que la lucha por la perla de Shikon se perpetúe encerrando a Kagome dentro de la perla y forzarla a pedir un deseo para hacer que su alma quede atrapada dentro de la perla junto con la de Naraku para que luchen por la eternidad del mismo modo que ocurriera con la antepasada de Kagome la Sacerdotisa Midoriko.
InuYasha persigue a Kagome dentro de la dimensión de la perla y tras reencontrarse con ella, la joven sacerdotisa del futuro pide un deseo a la perla: Que esta desaparezca para siempre terminando con Naraku de una vez por todas y acabando finalmente con este conflicto. Sin embargo, InuYasha y Kagome terminan separándose y el pozo que permite a ambos poder viajar en el tiempo, queda sellado. Pasan tres años en el periodo Sengoku y las cosas han cambiado para el grupo de InuYasha: Miroku y Sango se han casado y tienen tres hijos; Shippo ahora viaja a menudo fuera de la aldea de Kaede para convertirse en un Yōkai zorro más fuerte; Kohaku ha decidido continuar su viaje para convertirse en un exterminador de Yōkais y finamente Koga contrae matrimonio con Ayame. De vuelta al futuro, Kagome ya se ha graduado de la preparatoria y ahora tiene 18 años. Antes de que finalmente ella pudiera hacer funcionar de nuevo el pozo devorador de Huesos para poder volver a viajar en el tiempo. Con el apoyo de su madre y su familia, Kagome regresa al periodo Sengoku donde ella finalmente se reencuentra con su amado InuYasha y finalmente podrá quedarse con él como su esposa por el resto de su vida.
Personajes!!
- InuYasha (犬夜叉 trad. Inu: Perro, Yasha: del sánscrito Yaksha, figurativamente "demonio")
- Kagome Higurashi (日暮かごめ Higurashi Kagome, trad. en lengua hispana como Aome Higurashi)
- Miroku (弥勒 del sánscrito Maitreya)
- Sango (珊瑚); es una exterminadora de monstruos (退治屋 taijiya)
- Kirara (雲母)
- Shippō (七宝)
- Sesshōmaru (殺生丸)
- Kikyō (桔梗)
- Naraku (奈落 del sánscrito Naraka)
- Koga (鋼牙)
- Rin (りん)